非连续分子动力学模拟方法及其在大分子研究中的应用

闫策; 罗钟琳; 丁建东

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计算机模拟技术已成为大分子构象等基础研究的一种重要手段.非连续分子动力学模拟(DMD)与传统的分子动力学模拟(MD)方法有所不同,基于不连续势能和相关的模拟编程方法,运行速度大大提高.本文讨论了DMD方法的特点,总结了DMD方法的应用,重点以蛋白质折叠为例介绍了如何使用DMD方法,最后对DMD方法的发展前景进行了展望.

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来源
《功能高分子学报》 |2007年第4期|443-456|共14页
作者
闫策; 罗钟琳; 丁建东;
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作者单位

复旦大学高分子科学系,聚合物分子工程教育部重点实验室,上海,200433;

复旦大学高分子科学系,聚合物分子工程教育部重点实验室,上海,200433;

复旦大学高分子科学系,聚合物分子工程教育部重点实验室,上海,200433;

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正文语种 chi
中图分类聚合物水泥及其他专用水泥;
关键词
非连续分子动力学; 计算机模拟; 蛋白质折叠; 大分子构象; 多链体系;

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