低渗诱导凡纳滨对虾肝胰腺消减文库的构建及其表达序列标签分析

郜卫华; 迟淑艳; 谭北平; 刘泓宇; 董晓慧; 杨奇慧

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初始体重(0.27±0.01)g的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)分别于盐度2和30中饲养56 d,采用抑制性消减杂交技术构建低渗胁迫诱导的凡纳滨对虾肝胰脏差异表达基因消减cDNA文库.消减杂交效率分析显示,正反向消减文库差异表达的基因各富集大约25和25~10倍.从正反向两个文库中随机挑选200个阳性克隆进行测序(正向文库80个,反向文库120个),共获得179条序列长度大于100 bp的ESTs序列,经CAP3在线拼接程序得到73条Unigenes(19条contigs和54条singlets).生物学信息分析表明,这些Unigenes所代表的相应基因的功能包括免疫相关蛋白、代谢相关蛋白、核蛋白、细胞凋亡和转移蛋白.这些基因信息表明,凡纳滨对虾在低盐胁迫诱导所导致的生理变化非常复杂,构建的差异表达cDNA文库可较好地反映低盐胁迫对凡纳滨对虾影响的基因信息.

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来源
《广东海洋大学学报》 |2012年第6期|1-9|共9页
作者
郜卫华; 迟淑艳; 谭北平; 刘泓宇; 董晓慧; 杨奇慧;
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作者单位

广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;

长江大学动物科学学院,湖北荆州 434023;

广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;

广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;

广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;

广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;

广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类分子遗传学;十足目;
关键词
凡纳滨对虾; 肝胰脏; 低渗胁迫; 抑制性消减杂交(SSH); 表达序列标签(EST);

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