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一株海水氨氧化细菌的系统发育分析

         

摘要

应用PCR技术扩增16S rRNA基因和amoA(ammonia monooxygenase subunit A)的基因片段,并测定其序列,对一株源于海水养殖水体的高效氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria,AOB)进行了系统发育分析.结果表明,经PCR扩增得到了1 098 bp的16S rRNA基因片段和491 bp的amoA基因片段,将其序列用NCBI-Blast软件在GenBank数据库中进行同源性检索后发现,该菌株的16S rRNA基因序列和amoA基因序列分别与亚硝化单胞菌Nitrosomonas sp.NS20的相对应基因片段相似性分别为98.4%和96.7%.在此基础上构建了系统发育树,表明用该菌株的16S rRNA基因片段和amoA基因片段构建的系统发育树均与亚硝化单胞菌属类聚在一起,结合该菌株形态和生理生化特性,鉴定该株氨氧化细菌属亚硝化单胞菌.

著录项

  • 来源
    《广东海洋大学学报》 |2008年第3期|88-92|共5页
  • 作者单位

    广东海洋大学水产学院,广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室暨广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室,广东,湛江,524025;

    广东海洋大学水产学院,广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室暨广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室,广东,湛江,524025;

    广东海洋大学水产学院,广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室暨广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室,广东,湛江,524025;

    广东海洋大学水产学院,广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室暨广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室,广东,湛江,524025;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S917.1+Q939.1;
  • 关键词

    氨氧化细菌; 16S rRNA; amoA; 聚合酶链反应; 同源性分析;

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