高良姜倍半萜合成酶基因的生物信息学和表达分析

黄琼林; 郑伟穰; 黄学山; 吴民华

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高良姜倍半萜合成酶基因的生物信息学和表达分析

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目的明确高良姜倍半萜合成酶(sesquiterpene synthase,SES)基因及其编码蛋白的序列特征,以及在高良姜不同组织中的表达差异。方法基于前期建立的高良姜转录组数据,鉴定出SES基因的编码区序列,采用生物信息学分析SES基因编码蛋白的特征和功能,并运用实时荧光定量PCR(qPCR)检测SES基因在高良姜中的表达模式。结果在转录组数据中获得2个高良姜SES基因,分别命名为AoSES3和AoSES6。AoSES3和AoSES6的编码区长度分别为1 653 bp和1 647 bp,它们的编码蛋白为亲水性、混合型结构,均含有植物萜类环化酶和萜类合成酶等特异性功能域,且没有跨膜结构域、信号肽、转运肽、靶向肽等结构。编码蛋白AoSES3和AoSES6与其他植物来源倍半萜合成酶具有较高的序列相似度。AoSES3和AoSES6在高良姜叶片、茎和根茎中均有表达,AoSES3在叶片中表达最高,而AoSES6则在根茎中表达最高。结论成功获得了2个高良姜SES基因,为后续利用这些基因调控高良姜倍半萜类成分的生物合成奠定基础。

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来源
《广东药科大学学报》 |2022年第4期|84-88|共5页
作者
黄琼林; 郑伟穰; 黄学山; 吴民华;
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作者单位

广东医科大学;

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正文语种 chi
中图分类中药药理学;
关键词
高良姜; 倍半萜合成酶; 生物信息学; 表达分析;

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