基于网络药理学及分子对接探讨马齿苋治疗腹泻型肠易激综合征靶点分析

杨阳; 曹俊阳; 周协琛; 李涛; 李炎; 赵蕊

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通过网络药理学及分子对接技术分析马齿苋(Portulaca oleracea Linn,POL)治疗腹泻型肠易激综合征(diarrheal-irritable bowel syndrome,IBS-D)的作用机制。利用TCMSP数据库筛选POL活性成分并查找所选活性成分的相关靶点。在CTD、GeneCard数据库收集IBS-D的疾病靶点,使用Venny在线工具将POL活性成分靶点与IBS-D靶点映射取交集。通过String数据库构建交集靶点PPI网络并使用Cytoscape软件的Cytohubba插件挖掘POL抗IBS-D的核心基因。利用DAVID数据库和Cytoscape中clueGO插件进行基因本体论(Gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析,探究POL治疗IBS-D核心基因的生物学功能和信号通路。使用AMDOCK软件计算分子对接结合能并通过Pymol对分子对接结果进行可视化分析。结果表明POL活性成分共10个,对应靶点共194个,其中与IBS-D相关的共68个。拓扑学分析后得到TNF、IL-4、CXCL8等10个POL治疗IBS-D的核心靶点。核心靶点GO富集分析显示POL治疗IBS-D共涉及生物过程111项,细胞组分4项,分子功能8项。核心靶点KEGG富集分析结果表明,POL干预IBS-D主要与NLR、NF-κB、IL-17等信号通路有关。分子对接结果表明,RELA、JUN、IL-10可能是POL治疗IBS-D的关键靶点。综上,POL可能是IBS-D的潜在治疗剂,主要通过影响炎性反应、细胞因子-细胞因子受体相互作用、肠道免疫等方面发挥作用。

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来源
《黑龙江八一农垦大学学报》 |2023年第4期|87-95|共10页
作者
杨阳; 曹俊阳; 周协琛; 李涛; 李炎; 赵蕊;
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作者单位

黑龙江八一农垦大学;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类中药药理学;
关键词
马齿苋; 腹泻型肠易激综合征; 网络药理学; 分子对接;

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