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2018年大庆市某规模化猪场PEDV检测及S1基因遗传变异分析

         

摘要

为调查2018年大庆市某规模化猪场猪流行性腹泻病毒(PEDV)的感染及遗传变异情况,应用RT-PCR方法,对该规模化猪场的两个分场的仔猪腹泻样品进行PEDV S1基因扩增、测序及遗传进化分析.结果表明两个分场均存在PEDV感染;序列分析显示,两个分场PEDV S1基因序列核苷酸同源性为98.3%,推导氨基酸同源性为97.7%,与我国HGC-01-2015野毒株核苷酸同源性最高为99.0%,与2014年日本流行毒株ZK-O型毒株核苷酸同源性最低为84.9%.PEDV S1基因系统进化树分析显示,实验鉴定毒株均属于GⅡb亚群,与近年国内流行毒株及黑龙江省地区的流行毒株亲缘关系较近,与早期经典毒株CV777型毒株及国外流行毒株亲缘关系较远.

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