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鸡传染性法氏囊病病毒河南分离株HeYD VP2基因高变区基因克隆及序列分析

         

摘要

To identify the subtype of a field infectious bursal disease virus(IBDV) strain HeYD isolatedfrom Henan province, a pair of specific primers were designed according to the genome sequences of IBDV previously reported for amplifying the cDNA of IBDV VP2 hypervariable region.The VP2 hypervariable region of HeYD was cloned by reverse transcription polymerase chain reaction (RT - PCR), sequenced and compared with other reference IBDV strains.The resultsshowed that the amino acid sequence of HeYD VP2 hypervariable region represents the typical feature of those of very virulent IBDV (vvIBDV) strains at the positions of 222 (A), 256 (I), 294(I),and 299 (S).The phylogenetic tree based on the DNA sequences of IBDV VP2 hypervariable regions indicated that HeYD strain was far away from some of China vvIBDV stains,but close to other China vvIBDV strains such as xin - 1, GX8 - 99, and some foreign vvIBDV strains such as OKYM and DV86.%为初步确定新分离的鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)河南株HeYD的毒力,根据GenBank数据库中已报道的IBDV基因组序列,设计合成了1对VP2基因高变区特异性引物,应用RT-PCR方法对分离自河南省某发病鸡场的IBDV野毒株HeYD的VP2基因高变区进行了基因克隆及序列分析,并与其他参考毒株高变区进行了序列比对,序列分析结果表明,HeYD株的VP2基因高变区具有IBDV超强毒株典型的氨基酸序列特征,即222位(A)、256位(Ⅰ)、294位(Ⅰ)和299位(S),表明HeYD.为超强毒株.利用VP2基因高变区序列构建基因进化树,发现HeYD株与国内超强毒株如xin一1、GX8-99以及国外超强毒株如日本的OKYM和欧洲的DV86毒株亲缘关系较近.

著录项

  • 来源
    《河南农业科学》 |2011年第3期|149-153|共5页
  • 作者单位

    郑州大学生物工程系;

    河南;

    郑州;

    450001;

    河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室/河南省动物免疫学重点实验室;

    河南;

    郑州;

    450002;

    郑州大学生物工程系;

    河南;

    郑州;

    450001;

    河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室/河南省动物免疫学重点实验室;

    河南;

    郑州;

    450002;

    河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室/河南省动物免疫学重点实验室;

    河南;

    郑州;

    450002;

    河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室/河南省动物免疫学重点实验室;

    河南;

    郑州;

    450002;

    郑州大学生物工程系;

    河南;

    郑州;

    450001;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 家畜病毒学;
  • 关键词

    传染性法氏囊病病毒; VP2基因高变区; 基因克隆; 基因进化树;

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