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猪A组轮状病毒HN2019-01株的分离鉴定及VP6基因序列分析

         

摘要

为了解猪轮状病毒(RV)在河南省的流行情况及其分子遗传特征,利用反转录PCR方法,从河南某猪场腹泻样品中扩增得到RV特异性核酸片段,并将腹泻样品利用MA-104细胞进行RV的分离和传代,将分离得到的RV命名为RVA/Pig-wt/HN2019-01.对分离毒株VP6基因片段的序列测定及生物信息学分析结果表明,分离毒株VP6核苷酸序列与猪源毒株西南株-1C(SWU-1C)相似性最高,病毒分类上同属I5亚群.VP6蛋白全长397个氨基酸,存在4个N糖基化位点和18个潜在磷酸化位点,二级结构主要由α-螺旋组成,三级空间结构与牛轮状病毒RF株VP6蛋白高度相似,且在2个细胞毒性T淋巴细胞(CTL)抗原表位区域的氨基酸序列保守.

著录项

  • 来源
    《河南农业科学》 |2021年第6期|125-133|共9页
  • 作者单位

    南阳师范学院 生命科学与农业工程学院 河南 南阳 473061;

    南阳师范学院 生命科学与农业工程学院 河南 南阳 473061;

    南阳师范学院 生命科学与农业工程学院 河南 南阳 473061;

    南阳师范学院 生命科学与农业工程学院 河南 南阳 473061;

    河南省畜禽保健品工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

    河南省动物疫病诊断与综合防控工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

    南阳师范学院 生命科学与农业工程学院 河南 南阳 473061;

    河南省畜禽保健品工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

    河南省动物疫病诊断与综合防控工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

    南阳师范学院 生命科学与农业工程学院 河南 南阳 473061;

    河南省畜禽保健品工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

    河南省动物疫病诊断与综合防控工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

    南阳师范学院 生命科学与农业工程学院 河南 南阳 473061;

    河南省畜禽保健品工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

    河南省动物疫病诊断与综合防控工程技术研究中心 河南 南阳 473061;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 病毒病;
  • 关键词

    轮状病毒; A组轮状病毒; 病毒分离; VP6基因; 序列分析;

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