灰盖拟鬼伞GH9家族内切葡聚糖酶的生物信息学分析

柴倩囡; 韩彦弟; 张富霞; 王文丽; 邵莉桃; 王璐杰; 汉佳昕; 胡娇; 牛鑫

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真菌能够诱导分泌纤维素酶,其中GH9家族蛋白是其中具有内切葡糖酶活性的纤维素酶成员之一.本研究利用生物信息学方法,分析了灰盖拟鬼伞GH9蛋白(Cc_GH9)的编码基因序列、基本理化性质、信号肽、亚细胞定位、跨膜螺旋、二级结构、三级结构、磷酸化位点、O-糖基化修饰位点、功能结构域、系统进化以及基序分析,为该基因后续的生理功能研究奠定基础,也为灰盖拟鬼伞纤维素酶的开发提供新思路.结果表明:Cc_GH9基因含有10个内含子,编码基因全长1770nt,编码589个氨基酸.Cc_GH9的N端前21个氨基酸为信号肽序列,为分泌性蛋白,定位于胞外,是稳定亲水性蛋白,在556～578位氨基酸为跨膜螺旋部分,属于跨膜蛋白.二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,在29个丝氨酸(S)上、17个苏氨酸(T)上和17个酪氨酸(Y)上可能发生磷酸化修饰,在182位丝氨酸(S)处可能发生O-糖基化修饰,含有Glyco_hydro_9保守结构域,与拟鬼伞Coprinopsis marcescibilis的GH9蛋白亲缘关系最近,包含3个基序.

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来源
《河西学院学报》 |2021年第5期|61-70|共10页
作者
柴倩囡; 韩彦弟; 张富霞; 王文丽; 邵莉桃; 王璐杰; 汉佳昕; 胡娇; 牛鑫;
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作者单位

河西学院甘肃省应用真菌工程实验室/甘肃省食用菌遗传育种重点实验室/祁连山食用菌产业协同创新中心;

河西学院农业与生态工程学院;

河西学院农业与生态工程学院;

河西学院农业与生态工程学院;

河西学院农业与生态工程学院;

河西学院农业与生态工程学院;

河西学院生命科学与工程学院甘肃张掖 734000;

河西学院农业与生态工程学院;

河西学院甘肃省应用真菌工程实验室/甘肃省食用菌遗传育种重点实验室/祁连山食用菌产业协同创新中心;

河西学院农业与生态工程学院;

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正文语种 chi
中图分类其他;
关键词
灰盖拟鬼伞; GH9家族; 内切葡聚糖酶; 纤维素酶; 生物信息学;

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