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应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组

         

摘要

首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝脏蛋白质的表达差异.共鉴定357种蛋白质,6个时间点共有60种蛋白质的表达量与对照组(手术切下的正常肝组织)有显著差异.其中,ADH1(Alcohol dehydrogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的表达变化趋势与已有报道相同,GO(Gene ontology)的蛋白质功能注释提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A- Ⅰ)等可能通过影响细胞凋亡和能量供给等方式参与肝再生调控.聚类分析表明,术后12 h和24 h蛋白质的整体表达模式相似,6 h与此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h与这些时间点相差最远.该研究验证了8标iTRAQ是并行处理多组样本的有效技术,适合于生理和病理过程多时间点蛋白质组的定量差异分析,可以监控关键分子的动态变化,更易发掘重要的调控靶点分子.该文为进一步探讨肝再生机理提供了有价值的线索.

著录项

  • 来源
    《分析测试学报》 |2010年第5期|421-429|共9页
  • 作者单位

    复旦大学,生物医学研究院,系统生物学实验室,上海,200032;

    复旦大学,生物医学研究院,系统生物学实验室,上海,200032;

    复旦大学,生物医学研究院蛋白质组研究中心,上海,200032;

    复旦大学,生物医学研究院,系统生物学实验室,上海,200032;

    复旦大学,生物医学研究院,系统生物学实验室,上海,200032;

    北京放射医学研究所,北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京,102206;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 质谱分析;蛋白质;
  • 关键词

    iTRAQ; 2D LC-MS/MS; 肝脏再生; 差异蛋白质组;

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