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水环境下氢氧根水分子簇催化缬氨酸旋光异构及羟自由基致其损伤机理

         

摘要

基于MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-31+G(d,p)双理论水平,用自洽反应场(SCRF)理论的SMD模型方法,考察水环境下氢氧根水分子簇催化缬氨酸旋光异构及羟自由基致其损伤机理.结果表明:缬氨酸的旋光异构可在2个通道a和b实现,通道a为氢氧根水分子簇与α-H和氨基通过氢键作用形成底物,氢氧根抽取α-H后,α-C在另一侧抽取水分子的H;通道b为氢氧根水分子簇与 α-H和羰基通过氢键作用形成底物,氢氧根抽取α-H后,α-C在另一侧抽取水分子的H,通道b中的水分子辅助羟自由基抽取α-H可致缬氨酸损伤;水液相环境下,构象Val-1(氨基羧基间为单氢键)和构象Val-2(氨基羧基间为双氢键)在通道a旋光异构的决速步骤能垒分别为60.57,65.24 kJ/mol,在通道b旋光异构的决速步骤能垒分别为56.76,64.11 kJ/mol,羟自由基水分子簇致缬氨酸在通道b的损伤为温和的放热反应.

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