杂色鲍幼虫变态及TR干扰下内参基因的筛选

张丽莉; 徐建波; 王国栋; 王艺磊

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杂色鲍幼虫变态及TR干扰下内参基因的筛选

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内参基因的稳定性对实时定量PCR的结果影响巨大。采用Ge Norm、norm Finder和Ref Finder三款软件比较了鲍变态和干扰幼虫甲状腺激素受体(TR)两种情况下内参基因的稳定性。软件分析了EIF5A、OAZ1、YB1、RPL3、RPS9和ACT等6个候选内参基因的C_t值,据此获得各基因的稳定值。在杂色鲍幼虫的变态过程中,EIF5A稳定性最高,排名平均数为1,表明该基因可以作为这一阶段实时定量PCR的内参基因,但是在干扰TR情况下,EIF5A的稳定性下降,排名平均数为3.91。RPS9则与之相反,在变态过程该基因表达稳定性最差,而在干扰TR时表达稳定性最好。ACT在两种情况下稳定性较好,排名平均数均位列第二位,可以作为这两种情况下的通用内参基因。其他基因的稳定性在这两种情况下也发生剧烈变换。这表明内参基因的稳定与样品具体处理情况关系密切。为了保证定量PCR结果的准确性,需要针对具体处理情况相应地进行内参基因的稳定性评估。

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来源
《集美大学学报：自然科学版》 |2018年第2期|91-98|共8页
作者
张丽莉; 徐建波; 王国栋; 王艺磊;
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作者单位

集美大学水产学院;

农业部东海海水健康养殖重点实验室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类水产生物学;
关键词
杂色鲍; 内参基因; 稳定性;

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