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酸性稻田土n-damo细菌的多样性和丰度

         

摘要

亚硝酸盐依赖型甲烷厌氧氧化(n-damo)细菌是新近发现的一类具有特殊功能的微生物,在废水深度脱氮领域具有潜在应用前景.研究利用n-damo菌16S rRNA和pmoA基因的专一性引物,通过系统发育分析和定量PCR技术,检测酸性稻田土中该类群的多样性和丰度.结果显示,在弱酸性中等养分水平的稻田土中,n-damo菌聚为3~4个OTUs类群;系统发育分析表明,酸性稻田土中存在新型未知n-damo类群;n-damo细菌丰度较高,16S rRNA基因拷贝数可达1.25~2.31×108拷贝每克干重,pmoA基因拷贝数为8.66×106~2.54×107拷贝每克干重.研究为后续富集培养嗜酸型n-damo菌提供可靠菌源.

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