人胎儿骨膜全长cDNA文库的构建及测序

王绍海; 刘勇; 宫伟雁; 郑睿敏; 林守清

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人胎儿骨膜全长cDNA文库的构建及测序

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目的构建人胎儿的骨膜组织的全长cDNA文库,了解该组织表达谱的特征。方法以胎儿胫骨骨膜为材料,运用末端模板转换技术(SMART)构建cDNA文库,测定库容量并应用菌落PCR的方法确定平均插入片段长度,随后大规模测序并进行生物信息学处理分析。结果所构建的cDNA文库的库容量为5.2×106,平均插入片段的长度为1.2kb。随机测序了25000余个克隆的序列,拼接后为5230个聚类群(contigs)和4714个独立EST(singleton),Blast比对分析得到骨膜基因表达谱的概况,发现了23个候选的新基因。结论构建的骨膜组织的cDNA文库质量满足后续工作的需要,骨膜组织基因表达谱及一些新基因的获得为今后寻找骨膜组织特异性的基因从而研究骨相关疾病的发病机制、发现具有药物开发靶点的功能基因奠定了基础。

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来源
《医学分子生物学杂志》 |2007年第4期|319-323|共5页
作者
王绍海; 刘勇; 宫伟雁; 郑睿敏; 林守清;
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作者单位

中国医学科学院中国协和医科大学北京协和医院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类脱氧核糖核酸（DNA）;
关键词
全长cDNA文库; 末端模板转换技术; DNA测序; 生物信息分析;

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