紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析

潘妍妍; 王嘉琦; 杨孙玉悦; 蒋冬花

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紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析

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McrA为最近在构巢曲霉(Aspergillus nidulans)中发现的全局调控因子,具有调控丝状真菌生长发育和次级代谢的作用,利用生物信息学分析方法找到并克隆紫色红曲霉(Monascus purpureus)中mcrA基因,将其命名为MpMcrA。分析MpMcrA蛋白质理化性质、亲疏水性、亚细胞定位、信号肽、跨膜区域及磷酸化位点、转录因子结合位点以及蛋白质二级结构。利用ProtParam、ProtScale、PSORTII、SignalP4.1等生物信息学软件对MpMcrA进行系统分析。结果表明,MpMcrA基因长1356 bp,其中含有3个外显子,2个内含子,编码410个氨基酸,与构巢曲霉序列比对蛋白相似性高达64%。预测结果显示,MpMcrA属于亲水蛋白,位于细胞核可能性大,不存在跨膜区域,不属于膜蛋白;不存在剪切位点,不属于分泌蛋白;基因含有54个潜在的磷酸化位点;可能存在5个转录因子结合位点;蛋白结构大部分为无规则卷曲,整体结构较松散。对MpMcrA基因进行了生物信息学分析,得到了基因特征和分析结果。初步确定MpMcrA基因为构巢曲霉同源mcrA基因,在红曲霉中未见有报道。

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来源
《微生物学杂志》 |2023年第3期|11-18|共8页
作者
潘妍妍; 王嘉琦; 杨孙玉悦; 蒋冬花;
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作者单位

浙江师范大学化学与生命科学学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类微生物遗传学;
关键词
紫色红曲霉; 全局调控因子; 生长发育; 次级代谢; 生物信息学; MpMcrA基因;

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