肠道噬菌体组生物信息学分析方法的研究进展

胡晴玥; 李德志; 刘箐

首页> 中文期刊> 《微生物学杂志》 >肠道噬菌体组生物信息学分析方法的研究进展

肠道噬菌体组生物信息学分析方法的研究进展

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

噬菌体是感染细菌的病毒,广泛存在于各类环境中。由于传统实验研究的局限性及噬菌体基因的特异性,导致对肠道噬菌体的研究很少。随着宏基因组测序技术的发展和各种生物信息分析软件的开发,可以通过噬菌体组学,加深对肠道噬菌体的认识。噬菌体组分析流程主要包括原始数据质量控制和预处理,病毒基因组序列的拼接组装,类病毒颗粒的筛选和系统分类注释以及进化分析和预测相应宿主细菌。本文对噬菌体组分析流程和其中所需要的常用生物信息分析工具和数据库进行详细的介绍,可以为肠道噬菌体研究以及相关的研究人员提供参考。

著录项

来源
《微生物学杂志》 |2022年第3期|89-99|共11页
作者
胡晴玥; 李德志; 刘箐;
展开▼
作者单位

上海理工大学健康科学与工程学院;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类应用微生物学;
关键词
肠道噬菌体; 生物信息学; 噬菌体组; 病毒组; 机器学习软件; 数据库;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 大肠埃希氏菌噬菌体Bp38全基因组测序及生物信息学分析 [J] . 史玉青 ,赵尊福 ,阳亭亭 . 动物医学进展 . 2022,第6期
2. 烟草青枯菌FQY_4基因组中原噬菌体生物信息学分析 [J] . 蔡刘体 ,刘艳霞 ,孟琳 . 中国烟草学报 . 2015,第1期
3. 肠道噬菌体、肠道菌群与自身免疫性疾病的研究进展 [J] . 柏欢欢 ,张文琦 ,王颖 . 医学研究杂志 . 2022,第4期
4. 肠道噬菌体组与人体健康 [J] . 王悦 ,陈倩 . 微生物与感染 . 2019,第5期
5. 基于转录组测序生物信息学分析的研究进展 [J] . 宋尚桥 ,马围围 ,张超龙 . 中国畜牧兽医 . 2020,第002期
6. 分枝杆菌前噬菌体研究:基于前噬菌体分析的生物信息学学台 [C] . 樊祥宇 ,谢建平 . 中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会 . 2013
7. 利用多维度的生物信息学方法分析预电刺激小脑顶核后脑缺血的转录组数据 [A] . 徐琛 . 2020

肠道噬菌体组生物信息学分析方法的研究进展

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅