野猪源与家猪源PRRSV陕西分离株全基因测序与遗传进化分析

张冲; 武小椿; 王波; 韩青松; 杨增岐

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【目的】研究野猪源与家猪源猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syn-drome virus,PRRSV）陕西分离株的遗传变异情况及分子生物学特征。【方法】根据VR-2332和HB-1（sh）/2002毒株序列设计引物,对2株PRRSV陕西分离毒株Shaanxi-1（家猪源）、Shaanxi-2（野猪源）全基因分段进行扩增并测序,将测序结果依次拼接得到病毒的全基因,然后进行序列的比对分析。【结果】PRRSV Shaanxi-1、Shaanxi-2毒株高度同源且均属于美洲型毒株,它们与2006年以前分离的毒株相比存在明显差异（与BJ-4株的核苷酸同源性仅为89%）,而与高致病性PRRSV（HP-PRRSV）保持较高的同源性（相似率为99%左右）。Shaanxi-1、Shaanxi-2分别呈现不同的变异特点,Shaanxi-1 ORF3、ORF5基因变异较大,ORF6、ORF7较为保守;Shaanxi-2 ORF7基因变异最大,ORF3~ORF6较为保守。分析发现,Shaanxi-1、Shaanxi-2具有HP-PRRSV的分子特征,但部分位点氨基酸的突变明显区别于HP-PRRSV。【结论】不同来源的Shaanxi-1、Shaanxi-2毒株均属于HP-PRRSV演化中的一个分支,但其发生了部分变异,使其具备了新的特点。

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来源
《西北农林科技大学学报：自然科学版》 |2011年第2期|9-16|共9页
作者
张冲; 武小椿; 王波; 韩青松; 杨增岐;
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作者单位

西北农林科技大学动物医学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类家畜病毒学;
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒; 野猪与家猪; 全基因测序; 遗传进化分析;

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