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北美鹅掌楸NAC基因的克隆与表达分析

         
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基于鹅掌楸[Liriodendron chinense (Hemsl.) Sarg.]转录组信息,对北美鹅掌楸(L.tulipifera Linn.) NAC(NAM、ATAFl/2及CUC2)家族基因的结构和功能进行研究.采用RACE技术从北美鹅掌楸叶片中克隆出16个LtNAC基因的开放阅读框(ORF),编号为LtNAC01至LtNAC16.16个LtNAC基因的ORF长度为561～1 830 bp,编码187～610个氨基酸.根据理论等电点(pI),在LtNAC基因编码的16个LtNAC蛋白中,9个为碱性蛋白质,7个为酸性蛋白质.根据蛋白质疏水性(GRAVY),16个LtNAC蛋白中,13个为亲水蛋白质,3个为两性蛋白质.蛋白质二级结构预测结果显示:16个LtNAC蛋白均以无规则卷曲为主要构成元件,α螺旋、延伸链和β转角则散布于整个蛋白质中.系统进化分析结果表明:北美鹅掌楸16个LtNAC基因可能并不参与细胞壁的生物合成,其中,Lt NA C02、LtNAC03和Lt NA C04基因可能参与北美鹅掌楸的胁迫响应.LtNAC03、LtNAC07、LtNAC08、LtNAC09、LtNACl1、LtNAC12、LtNAC14、LtNAC15和LtNAC16基因的相对表达量与北美鹅掌楸叶片衰老程度呈现相关性,推测该9个LtNAC基因可能参与调控叶片衰老.

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