雨生红球藻植物类型隐花色素基因克隆与序列分析

杭伟; 张宏江; 马浩天; 王晓丹; 许文鑫; 赵春超; 李润植; 崔红利

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cqvip:为了从雨生红球藻中获得感知蓝光信号的植物类型隐花色素(CRY)序列,采用同源克隆和RACE相结合的方法获得了雨生红球藻编码植物类型Hae-P-CRY的cDNA全长,并对其序列进行生物信息学分析。结果表明,Hae-P-CRY基因的cDNA全长为3608 bp,包含开放阅读框全长2988 bp,编码995个氨基酸,预测等电点6.19,理论分子质量为107.7 ku。经Blast P分析发现,Hae-P-CRY氨基酸序列与莱茵衣藻来源植物类型CreCRY氨基酸序列的相似性达到66.6%,与拟南芥CRY氨基酸序列相似性为46.94%。系统进化分析表明,Hae-P-CRY与其他真核绿藻来源的植物型CRY聚在一支,属于植物类型CRY。结构域分析表明,Hae-P-CRY基因含有光感知PHR结构域和信号转导CCT结构域,暗示具有感知和转导光信号功能。试验从雨生红球藻得到植物类型Hae-P-CRY基因序列,可为其表达、功能及互作蛋白研究奠定基础,同时为进一步解析雨生红球藻在蓝光响应中的分子机制奠定基础。

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来源
《山西农业科学》 |2020年第5期|677-682|共6页
作者
杭伟; 张宏江; 马浩天; 王晓丹; 许文鑫; 赵春超; 李润植; 崔红利;
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作者单位

山西农业大学分子农业与生物能源研究所山西太谷 030801;

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正文语种 chi
中图分类水产植物学;
关键词
雨生红球藻; 隐花色素; 基因克隆; 生物信息学分析;

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