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戴东波; 熊赟n; 朱扬勇;
复旦大学;
计算机科学技术学院;
上海;
200433;
序列相似性查找; 参考集索引; 编辑距离;
机译:基于格方法的低基数密集和稀疏数据集的频繁项集查找算法
机译:引文归一化的新方法:基于相似性的参考集创建方法
机译:基于相似性的描述符(SIBAR)作为P-糖蛋白抑制剂QSAR研究的工具:参考集的影响
机译:用于支持标记集的高效相似性搜索的多级分层索引结构
机译:时间序列和多类识别的相似性度量和索引方法。
机译:全面自动更新的真菌ITS序列数据集可用于环境测序工作中基于参考的嵌合体控制。
机译:图4:(a)一种保守序列,其发生在芯片-SEQ数据集中的46,264个结合位点峰值中的79倍。说明了这种保守序列的突变分布,其中'_'表示该碱度不变; del表示此基础丢失; INS X表示新的基础X插入此基础前面。 (b)列出了几种重复的元素模式。 (c)在第一栏中,示出了由MEME芯片工具(Machanick&Bailey,2011)开采的前五个DNA主题。由CFSP算法发现的相应保守序列列于第二列中。在第三列中,列出了从突变信息转换的特定位置的评分矩阵。 MEME主题与PSSM格式的相似性与PSSM格式之间的相似性通过邮票图章比较工具(Mahony&Benos,2007)计算。这些对相似性的电子值显示在第四列中。 (d)在由GKMSVM描述符聚集的每个组中选择了一个图案,下面列出了CFSP算法的相应主题。 (e)从https://www.encodeproject.org收集的,有附加数据集(文件no:cernff100grl,cenf616irl,conf8.20cer,target:srebf1)。使用MEME工具在每个文件中选择前两个图案,并且我们的算法发现的相应主题如下所示。
机译:基于磷脂脂肪酸序列与异化硫酸盐还原菌核糖体RNa序列相似性的系统发育关系比较
机译:基于磁盘的概率集相似性索引
机译:数值序列数据相似性搜索的索引结构及其相似性搜索方法
机译:用于从图像流中提取图像或视听序列的图像或视听序列提取方法,其中分析图像以生成参考索引,并将其与当前索引进行比较
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