链霉菌新物种Streptomyces wensuensis TRM68367全基因组测序及生物信息学分析

曹然; 罗晓霞; 张利莉

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Streptomyces wensuensis TRM68367是一株分离自新疆阿克苏温宿县台兰河淤泥的链霉菌新物种,对其进行活性筛选发现该菌株对蜡状芽孢杆菌具有抑菌活性.本研究采用Illumina Hiseq 2000测序平台对菌株Streptomyces wensuensis TRM68367进行全基因组测序及生物信息学分析,发现TRM68367基因组大小为8297736 bp,GC含量为71.43％,预测到9186个基因组开放读框(ORFs);通过对次级代谢产物进行预测分析,共预测到33个潜在次级代谢生物合成基因簇,结果表明TRM68367具有较强的产次级代谢产物的潜力,为深度挖掘次级代谢产物奠定了理论基础.

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来源
《塔里木大学学报》 |2021年第3期|1-9|共9页
作者
曹然; 罗晓霞; 张利莉;
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作者单位

塔里木大学生命科学学院新疆阿拉尔 843300;

塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔 843300;

塔里木大学生命科学学院新疆阿拉尔 843300;

塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔 843300;

塔里木大学生命科学学院新疆阿拉尔 843300;

塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔 843300;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类微生物遗传学;
关键词
温宿链霉菌; 全基因组测序; 生物信息学;

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