棉花FT基因的特征和表达分析

刘春艳; 刘杰; 陈伟; 朱守鸿; 李燕; 曹新川; 何良荣; 张永山

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棉花FT基因的特征和表达分析

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利用生物信息学方法对13个棉种(二倍体棉8个、四倍体棉5个)的FT基因进行鉴定,并对其序列特征、进化关系、基因结构、蛋白结构、顺式作用元件进行分析;以陆地棉TM-1为试验材料,予以3种不同的光周期处理,利用qRT-PCR技术对陆地棉中的FT基因(GhFT基因)的时空表达特征进行定量验证.结果表明,13个棉种共获得18个FT基因,并且这些FT基因的理化性质差异不大,转录本长度普遍为525 bp,编码蛋白质长度为174个氨基酸,等电点介于6.73和9.45之间,平均分子量为19.56 kD;系统进化分析显示18个FT基因分为2组,组Ⅰ仅有2个成员,组Ⅱ包含16个成员;蛋白结构分析发现,所有FT基因均含有4种模体,具有相似的功能,同一组的FT基因含有相同的保守结构域;基因结构分析发现,同一类群的基因所含外显子和内含子数量相同,结构相似.田间自然光照条件下,GhFT基因在棉花各组织中的表达量存在较大差异,在苞叶和萼片中优势表达,在根、下胚轴中几乎不表达;长日照条件下(昼16 h/夜8 h),GhFT基因在叶片中的表达随着叶龄的增长而增强;24 h内GhFT基因在叶片和根中的表达量变化呈昼夜节律变化,GhFT基因长日照处理下叶片中的表达量显著高于根中的表达量,而在短日照(昼8 h/夜16 h)处理下相反.本试验旨在为研究GhFT基因在棉花发育调控中的作用提供参考.

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来源
《塔里木大学学报》 |2021年第3期|61-70|共10页
作者
刘春艳; 刘杰; 陈伟; 朱守鸿; 李燕; 曹新川; 何良荣; 张永山;
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作者单位

塔里木大学植物科学学院新疆阿拉尔 843300;

中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳 455000;

塔里木大学植物科学学院新疆阿拉尔 843300;

中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳 455000;

中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳 455000;

中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳 455000;

塔里木大学植物科学学院新疆阿拉尔 843300;

塔里木大学植物科学学院新疆阿拉尔 843300;

中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳 455000;

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正文语种 chi
中图分类棉;
关键词
陆地棉TM-1; GhFT基因; 不同组织; 表达量;

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