普通大蓟马MuRhodopsin基因的全长克隆及生物信息学分析

金海峰; 王朝政; 侯清芳; 咸利民; 张华剑; 吴少英

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为了解蓟马害虫视蛋白分子结构及特征，根据普通大蓟马（Megalurothrips usitatus）转录组信息克隆获得了视紫红质MuRhodopsin的基因cDNA全长，并利用DNAMan 9.0和SWISSMODEL等软件对视紫红质MuRhodopsin的基因进行序列同源性比对并构建基因系统进化树，分析理化性质及结合域特点，并对该蛋白进行结构预测。结果表明：该基因全长1 140 bp，共编码380个氨基酸，相对分子质量为42.73 kDa，理论等电点为8.47。序列比对以及同源性分析结果表明，MuRhodopsin为横纹视紫红质（rhabdomeric opsins,r-opsins）与西花蓟马（Frankliniella occidentalis）及棕榈蓟马（Thrips palmi）具有高度同源性。结构域分析表明该蛋白具有7个跨膜结构域，包含了1个G蛋白偶联受体家族区域，隶属于G蛋白偶联受体家族；具有6个N-豆蔻酰化位点，3个N-糖基化位点，3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点，4个蛋白激酶C磷酸化位点；其第322位氨基酸—赖氨酸（K）为与发色团（视黄醛）的重要结合位点，具有典型的视蛋白能够激活IP3/Ca2+信号通路引起光依赖的去极化反应。

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来源
《热带生物学报》 |2023年第6期|651-659|共9页
作者
金海峰; 王朝政; 侯清芳; 咸利民; 张华剑; 吴少英;
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作者单位

1. 海南大学三亚南繁研究院 2. 海南大学植物保护学院 3. 海口海关技术中心;

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正文语种 chi
中图分类其他害虫;
关键词
普通大蓟马; Rhodopsin基因; 视蛋白; 序列分析; 结构预测;

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