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海南坡鹿MD2cDNA的克隆及其生物信息学分析

         

摘要

以海南坡鹿外周血白细胞总RNA为模板,利用RT-PCR技术,获得海南坡鹿MD2全长cDNA,并对其进行较系统的生物信息学分析,内容包括序列特征分析、同源性分析、编码蛋白质理化性质及结构预测.结果表明:海南坡鹿MD2的CDS序列长度为486 bp,编码160个氨基酸,与黄牛、人、欧洲兔、褐家鼠的核苷酸序列同源性分别为98.55%,77.43%,78.47%和74.74%.该基因编码的蛋白质相对分子质量约为19×103,理论等电点为8.18.对编码蛋白的分子结构预测发现,该蛋白为非跨膜蛋白,其二级结构中,α-螺旋占16.25%,β-折叠片占38.13%,无规则卷曲占45.63%.

著录项

  • 来源
    《热带生物学报》 |2011年第1期|1-5|共5页
  • 作者单位

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

    海南大学农学院;

    海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室(筹);

    海口市动物基因工程重点实验室;

    海南海口570228;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 基因的表达;
  • 关键词

    海南坡鹿; MD2; 克隆; 生物信息学分析;

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