GIRK2通道外流门控机制的分子动力学模拟

王瑞; 赵伊婷; 石定媛; 李岱霖; 林嫣

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GIRK2通道外流门控机制的分子动力学模拟

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为深入理解外流调控型病理或药效机制,采用全原子分子动力学模拟方法,在外向电场作用下,对不同因子(Na+、Gβγ、Na+-Gβγ)调控下的GIRK2通道进行微秒级分子动力学模拟,揭示GIRK2通道的外向电流门控机制。结果表明:Na+和Gβγ亚基协同作用激活GIRK2通道,Na+使得GIRK2通道G-loop门控打开概率高达94.6%,显示出G-loop门控的调节作用;Gβγ主要影响HBC门控,使其打开概率为73.6%。CTD结构域内向摆动约148.8°和TM2-CTD逆向旋转约11.9°可导致G-loop门激活,而CTD外向摆动和TM2外向倾斜约38.3°导致HBC门激活。

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来源
《厦门理工学院学报》 |2023年第3期|88-95|共8页
作者
王瑞; 赵伊婷; 石定媛; 李岱霖; 林嫣;
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作者单位

厦门理工学院环境科学与工程学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类环境微生物学;分子生物物理学;
关键词
GIRK2通道; 外流门控机制; 分子动力学;

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