肺腺癌患者血清中非编码RNA差异表达的分析研究

牛海文; 崔浩波; 李宏; 曹国磊; 何丽丽; 曹嘉芮; 张迪; 罗琴

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目的研究肺腺癌患者外周血中非编码RNA的表达差异。方法收集新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1月—2019年12月呼吸神经内科收治的肺腺癌患者与健康对照组的外周血各4例,利用TRIZOL试剂盒提取两组患者外周血中RNA,采用RNA-Seq高通量测序检测lncRNA表达谱,利用lncTar软件对差异表达的lncRNA和mRNA行共表达分析,进而采用KOBAS软件对mRNA行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析。结果与对照组相比,肺腺癌患者外周血中有804个差异表达的lncRNA(其中425个表达上调,379个表达下调,P≤0.05),对存在差异的lncRNA靶向的mRNA行GO分析发现,肺腺癌对比健康人主要与翻译起始、mRNA分解过程相关,KEGG主要与核糖体、代谢途径等通路相关。结论LINC02193、SNHG17、TUG1、LINC01503可作为肺腺癌发生发展的标志物,肺腺癌的发生可能与核糖体、代谢途径等通路有关。

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来源
《新疆医科大学学报》 |2022年第1期|15-19|共5页
作者
牛海文; 崔浩波; 李宏; 曹国磊; 何丽丽; 曹嘉芮; 张迪; 罗琴;
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作者单位

新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸神经内科;

乌鲁木齐830011;

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正文语种 chi
中图分类呼吸系肿瘤;
关键词
肺腺癌; 高通量测序; 非编码RNA; 差异表达;

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