侵染昆明园林植物的4个HCRV分离株核壳体蛋白氨基酸序列分析

王宇琪; 吴保为; 陶宏征; 贾志强; 高雪; 王景文; 刘雅婷

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【目的】比较分析侵染昆明园林植物HCRV核壳体蛋白氨基酸序列,探究地理分布和寄主来源与病毒变异的相关性。【方法】2016年,在云南省昆明市园林景区采集疑似感染番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒样品,利用RT-PCR技术测定出葱莲(Zephyranthes candida)、文殊兰(Crinum asiaticum)、喜林芋(Philodendron schott)和酢浆草(Oxalis corniculata)4份感染朱顶红褪绿环斑病毒(Hippeastrum chlorotic ringspot virus,HCRV)的样品,通过克隆、测序获得4份样品的S RNA序列,利用ORF Finder获得核壳体蛋白(nucleocapsid protein,N)并进行序列分析。【结果】文殊兰、喜林芋和酢浆草是首次报道的HCRV新寄主;4个HCRV分离物的N蛋白与NCBI首次报道的HLS1-2 N蛋白(登录号:AFX74694)一致性达到99.34%;系统进化树分析显示:4个HCRV分离物与GenBank公布的同样来自云南的株系聚为1支。【结论】病毒的地理分布相关性强于寄主相关性。

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来源
《云南农业大学学报：自然科学版》 |2021年第1期|165-168|共4页
作者
王宇琪; 吴保为; 陶宏征; 贾志强; 高雪; 王景文; 刘雅婷;
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作者单位

云南农业大学农学与生物技术学院;

云南昆明650201;

云南农业大学植物保护学院;

云南昆明650201;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 S436.412.11;
关键词
朱顶红褪绿环斑病毒; 核壳体蛋白; 序列分析;

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