甜酸角基因组微卫星序列特征分析

廖礼彬; 杨时宇; 王兵益; 李体初

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甜酸角基因组微卫星序列特征分析

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甜酸角是干热河谷地区有多重价值的重要经济树种,对其SSR引物的开发有助于该物种的遗传学研究以及资源的利用与保护.研究通过Illumina高通量测序技术和MISA软件开发出甜酸角全基因组SSR序列,共7个类型9 447个,其中以单核苷酸重复类型最多.在不同重复类型中,A/T碱基含量显著高于G/C;在不同长度重复单元中,单核苷酸重复类型的微卫星长度变异程度最高,二核苷酸重复类型微卫星长度变异程度也较高,各重复类型微卫星的长度与微卫星出现的频率呈负相关.获得的微卫星序列以及相关分析结果,较全面地反映了甜酸角基因组微卫星的特征和潜在功能,将有助于后续的一系列遗传学研究.

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来源
《云南大学学报：自然科学版》 |2016年第6期|982-988|共7页
作者
廖礼彬; 杨时宇; 王兵益; 李体初;
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作者单位

中国林业科学研究院资源昆虫研究所;

云南昆明650224;

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正文语种 chi
中图分类树木遗传学;
关键词
甜酸角; 基因组; 微卫星; 标记开发;

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