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生物信息学方法预测病原体抗原蛋白序列中多肽疫苗候选表位

         

摘要

根据病原体抗原基因中具有免疫原性的表位氨基酸序列,通过化学合成技术可制备该病原体的多肽疫苗.相较于灭活和减毒疫苗,多肽疫苗因成分简单、特异性强、安全性高、易于保存等优点成为疫苗研发的重点.然而,特异有效的疫苗候选表位的预测和筛选,仍是限制多肽疫苗设计与研发的一个重要因素.本研究综合多个生物信息学工具,构建了一个可用于预测和筛选病原体多肽疫苗候选表位的操作流程.并且,基于严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的结构蛋白序列,该流程被成功地应用于其候选抗原表位的预测和筛选.最终,我们共筛选到34条关于SARS-CoV-2的T细胞候选表位,其中20条候选表位与数据库中经过验证的表位高度同源,且能够被T细胞受体(T cell receptor,TCR)识别.综上所述,本研究不仅为当下广泛蔓延的SARS-CoV-2的多肽疫苗设计提供了候选表位,还建立了一个广泛适用于多肽疫苗候选表位预测和筛选的工作流程.

著录项

  • 来源
    《生命科学研究》 |2021年第4期|363-371|共9页
  • 作者单位

    上海海洋大学食品学院 中国上海201306;

    上海市生物医药技术研究院上海生物信息技术研究中心 中国上海201203;

    上海市生物医药技术研究院上海生物信息技术研究中心 中国上海201203;

    上海市生物医药技术研究院上海生物信息技术研究中心 中国上海201203;

    上海市生物医药技术研究院上海生物信息技术研究中心 中国上海201203;

    上海市生物医药技术研究院上海生物信息技术研究中心 中国上海201203;

    中南大学湘雅医院生物信息中心 中国湖南长沙410008;

    上海海洋大学食品学院 中国上海201306;

    上海市生物医药技术研究院上海生物信息技术研究中心 中国上海201203;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 免疫学;研究方法;
  • 关键词

    生物信息学; 多肽疫苗; 候选表位; 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2);

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