基于转录组测序分析绿鳍马面鲀脑组织响应密度胁迫的分子机制

段晓晨; 程起群

首页> 中文期刊> 《海洋渔业》 >基于转录组测序分析绿鳍马面鲀脑组织响应密度胁迫的分子机制

基于转录组测序分析绿鳍马面鲀脑组织响应密度胁迫的分子机制

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

为了解密度胁迫下,绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)脑组织的分子响应机制,设置两个养殖密度试验组(100尾·m^(-3)的中密度组和500尾·m^(-3)的高密度组)和1个对照组(密度:50尾·m^(-3)),分别获得2个试验组绿鳍马面鲀在25 d和50 d时的脑组织样本,利用Illumina测序平台对绿鳍马面鲀脑组织样本进行转录组测序分析,得到100.3 Gb高质量测序数据。与对照组相比,各试验组均筛选出大量的差异表达基因。通过GO(Gene Ontology)功能注释与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能富集分析,筛选出与昼夜节律、MAPK信号通路、钙离子信号通路相关的信号通路,发现clock、cry、bmal1、npas2、bdnf、rps6ka、il1r1、htr5a、ryr2和pln等关键基因在不同密度下生存的绿鳍马面鲀脑组织中差异性表达。这些差异表达基因可能在调节绿鳍马面鲀的昼夜节律、免疫能力等方面发挥关键作用,研究结果可为研究该品种在密度胁迫下脑组织相关基因表达调控奠定基础。

著录项

来源
《海洋渔业》 |2022年第6期|725-735|共11页
作者
段晓晨; 程起群;
展开▼
作者单位

中国水产科学研究院东海水产研究所;

上海海洋大学水产与生命学院;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类水产动物学;
关键词
绿鳍马面鲀; 转录组; 密度胁迫; 基因表达; 脑组织;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 野生罗非鱼响应低温胁迫的脑组织转录组测序分析 [J] . 徐欣玉 ,刘洁 ,夏慧敏 . 南方农业学报 . 2022,第3期
2. 红鳍东方鲀及杂交鲀的脑和肾脏转录组比较分析 [J] . 刘福君 ,保明秀 ,荆笛 . 安徽农业科学 . 2020,第8期
3. 绿鳍马面鲀全基因组微卫星分布特征 [J] . 王九龙 ,李洪莉 ,尹硕 . 烟台大学学报:自然科学与工程版 . 2022,第3期
4. 基于线粒体Cytb基因序列的绿鳍马面鲀6个野生群体的遗传结构分析 [J] . 边力 ,王鹏飞 ,陈四清 . 中国水产科学 . 2018,第004期
5. 绿鳍马面鲀重复发育雄性生殖腺结构与发育组织学观察 [J] . 温海深 ,李吉方 ,杨艳平 . 海洋科学进展 . 2010,第002期
6. 基于线粒体控制区比较分析养殖与野生绿鳍马面鲀群体遗传多样性 [C] . 王志杨 ,刘名 ,官曙光 . 中国海洋湖沼学会、中国动物学会鱼类学分会2012年学术研讨会 . 2012
7. 绿鳍马面鲀繁殖生理及性激素合成关键酶的分子表达机制 [A] . 张冬茜 . 2013

基于转录组测序分析绿鳍马面鲀脑组织响应密度胁迫的分子机制

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅