急性髓细胞白血病基因筛选模型的贝叶斯分析

肖颖; 刘金山

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急性髓细胞白血病基因筛选模型的贝叶斯分析

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基因表达数据蕴含着大量的生物信息,在生物基因信息研究中,筛选表达水平发生显著变化的差异基因是认识疾病形成机理和辅助靶点药物研究的关键问题.根据急性髓细胞白血病（AML）的基因表达数据,构造基因均值差序列,建立贝叶斯分层混合模型,并为模型的参数赋予具有基因生物特征的先验信息.采用马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）算法对模型参数进行估计,并筛选出急性髓细胞白血病差异表达基因.在实际数据分析中,从美国生物信息中心（NCBI）的高通量基因表达数据库中获取急性髓细胞白血病基因数据集,从经过非特异滤波预处理的14688个急性髓细胞白血病基因中筛选出711个差异表达基因,差异表达基因数仅占急性髓细胞白血病基因总数的4.84%,这一结果与基因差异表达的生物学原理相吻合.

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来源
《数学的实践与认识》 |2019年第3期|157-165|共9页
作者
肖颖; 刘金山;
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作者单位

1. 华南农业大学数学与信息学院应用数学系 2. 广东金融学院金融数学与统计学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类急性白血病;
关键词
分层混合模型; 急性髓细胞白血病; 基因表达; MCMC算法;

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