高原肺水肿新型生物标记物的研究

袁牧; 邢伟; 徐祥

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目的研究高原肺水肿的发生和早期进展潜在生物标志物,进一步为高海拔肺水肿的发病和早期进展机制提供理论基础。方法从GEO数据库中提取出人类基因表达谱GSE52209,使用R软件在数据集中筛选急进入高原48~72 h内高原适应组和高原肺水肿组的差异表达基因(DEGs),通过GO和KEGG探究高原肺水肿的发生和早期进展机制,利用cytoscape软件的MCC算法鉴定枢纽基因,利用Lasso-Cox回归分析和ROC曲线分析预测和验证诊断标记物,利用R软件检测数据集枢纽基因的相对表达水平,利用networkanalyst和cytoscape软件鉴定与枢纽基因作用的miRNA和枢纽miRNA。结果共鉴定出DEGs 216个,其中196个基因表达上调,20个基因表达下调;GO和KEGG分析结果显示,DEGs主要与代谢异常和氧化应激相关;共筛选出7个高原肺水肿诊断标记物(ARRB2、RPLP0、JAK2、ICAM1、ESPL1、RAD54L、SEC61A1),结合gene-miRNA网络,hsa-miR-335-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-615-3p可能是高原肺水肿发生和早期进展相关的枢纽miRNA。结论ARRB2、RPLP0、JAK2、ICAM1、ESPL1、RAD54L、SEC61A1、hsa-miR-335-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-615-3p可能是高原肺水肿发病和早期进展的重要生物标记物,其中ARRB2、RPLP0、JAK2、ICAM1、ESPL1、RAD54L和SEC61A1可能是高原肺水肿的早期诊断标记物。

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来源
《医学信息》 |2023年第15期|12-18|共7页
作者
袁牧; 邢伟; 徐祥;
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作者单位

陆军军医大学大坪医院中心实验室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类肺疾病;
关键词
高原肺水肿; 发病机制; 诊断; 生物标志物; 枢纽基因; MIRNA;

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