GeneSifter在基因表达谱芯片数据挖掘中的应用

廖之君; 马文丽; 梁爽; 郑文岭

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GeneSifter在基因表达谱芯片数据挖掘中的应用

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介绍一款基因芯片数据分析工具--GeneSifter软件,具有快速、直观、便捷等特点,尤其适用于基因表达谱的数据挖掘.芯片数据一般以格式化文本文档形式上载,根据实验目的、设计不同,总共有4种上载向导工具,数据分析从控制台Analysis项目下的Pairwise或Projects进入,需要设置滤过、阈值和统计分析等参数,Pairwise可获得的结果有:差异显著性基因列表、基因本体报告和KEGG通路报告等,Projects有更为强大的功能,可获取聚类等6种结果.GeneSifter独特的一站式单击设置,可获得相关基因的11个数据库最新链接.GeneSifter适用于基因芯片数据挖掘的生物研究人员.

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来源
《医学信息》 |2007年第11期|1882-1887|共6页
作者
廖之君; 马文丽; 梁爽; 郑文岭;
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作者单位

南方医科大学基因工程研究所,广东,广州,510515;

福建医科大学生物化学与分子生物学系,福建,福州,350004;

南方医科大学基因工程研究所,广东,广州,510515;

南方医科大学基因工程研究所,广东,广州,510515;

华南基因组研究中心,广东,广州,510800;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类计算技术、计算机技术;预防医学、卫生学;
关键词
GeneSifter软件; 数据挖掘; 基因本体术语; KEGG通路; 聚类;

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