扩张型心肌病核心基因及其免疫浸润生物信息学分析

张清泉; 吴春宇; 范勐慷; 潘海燕; 潘闽

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扩张型心肌病核心基因及其免疫浸润生物信息学分析

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目的利用生物信息学分析筛选扩张型心肌病(DCM)发生的相关核心基因并分析其免疫细胞浸润情况。方法从GEO数据库中下载基因芯片数据集,利用多种算法分析差异表达基因,进行功能富集,构建加权共表达网络及蛋白互作网络,鉴定核心基因,挖掘免疫细胞的浸润情况,并利用外部数据集验证核心基因的诊断效能。结果共筛选出35个差异基因和包含114个基因的核心模块。其中,F13A1、VSIG4、CD163、RNASE2及LYVE1被鉴定为核心基因。DCM组织与健康心肌中的记忆B细胞、浆细胞、Tregs细胞、活化NK细胞、M2型巨噬细胞及中性粒细胞的含量具有统计学意义。结论筛选出的5个核心基因和6种免疫细胞可能参与了DCM的发生发展。

著录项

来源
《中南医学科学杂志》 |2022年第2期|202-205|共4页
作者
张清泉; 吴春宇; 范勐慷; 潘海燕; 潘闽;
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作者单位

南通大学附属医院心内科;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类心肌疾病;
关键词
扩张型心肌病; 生物信息学; 核心基因; 免疫浸润;

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