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海州湾近岸海域的微生物群落结构和抗生素抗性基因时空变化

         

摘要

【背景】近岸海域抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的污染和累积将直接影响海产品质量和安全,海州湾作为江苏省的四大渔场之一,是江苏渔业发展的主要载体,有多条大小河流注入,沿岸为重要农业区,对公众健康产生重大影响。【目的】对海州湾夏秋季的水样及沉积物展开微生物及ARGs检测。【方法】基于宏基因组测序技术开展海州湾夏秋两季近岸6个站点中水体和沉积物中ARGs种类和相对丰度以及微生物群落的组成研究。【结果】变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)是夏秋季度两种介质中最优势的门类,水样中优势的科级细菌为红细菌科(Rhodobacteraceae),沉积物样品中为脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae);夏季水样中的ARGs相对丰度要明显高于秋季,但沉积物中不同季节的ARGs相对丰度未表现出明显的变化趋势;在水样中主要门级微生物群落的抗性机制主要是抗生素靶位替换和抗生素靶位保护,沉积物样品则以抗生素灭活机制为主,而主要科级微生物群落的抗性机制更加多样;冗余分析(redundancy analysis,RDA)和典型对应分析(canonical correspondence analysis,CCA)发现硝酸盐及盐度等环境因子与ARGs的变化显著相关。【结论】海州湾近岸海域的微生物群落及ARGs组成在夏秋季不同介质中有明显差异,且不同介质中主要微生物群落的抗性机制不尽相同,ARGs的相对丰度和分布受盐度和硝酸盐等环境因子调控。研究结果为海州湾公共安全监测和生态环境的保护提供了理论依据。

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