高通量测序分析不同浓度的白鲜碱对须癣毛癣菌转录组的影响

吴建美; 高璐; 刘登宇; 尉迟邈; 曲琳

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[背景]目前,由皮肤浅部真菌引起的皮肤病逐年增加,已经成为影响人类健康的重大问题之一。[目的]探究白鲜碱(dictamnine,DIC)单体对须癣毛癣菌的抑菌作用及作用机制。[方法]通过高通量测序技术对须癣毛癣菌及白鲜碱作用后的须癣毛癣菌进行转录组测序,对测序序列进行处理和生物信息学分析,以及测序质量评价和序列注释。通过与对照组比较,鉴别出差异表达基因,然后进行GO功能显著性分析和KEGG代谢途径分析等。[结果]白鲜碱对须癣毛癣菌的MIC值为50μg/mL。DIC高剂量组与对照组比较,共360个差异基因;其中上调表达265个,下调表达95个。MFS1、KU70、KU80、L2、cpaT、MFS2、VdtG、patC等基因表达有显著差异。GO功能富集表明,差异基因主要集中于核糖体、线粒体膜、抗氧化活性、毒素代谢过程、单一生物代谢过程、次生代谢过程、初级活性跨膜转运蛋白活性和活跃的跨膜转运蛋白活性等。KEGG代谢途径的改变主要集中在ABC转运、膜运输障碍、谷胱甘肽代谢、DNA的复制与修复变化、减数分裂、氧化磷酸化和丙酮酸代谢障碍等富集通路上,并且相关基因均有显著性改变(P<0.05)。[结论]白鲜碱对须癣毛癣菌的抑菌机制可能与影响须癣毛癣菌DNA复制表达、能量代谢、DNA修复、ABC转运等途径有关。

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来源
《微生物学通报》 |2022年第2期|702-712|共11页
作者
吴建美; 高璐; 刘登宇; 尉迟邈; 曲琳;
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作者单位

内蒙古综合疾病预防控制中心;

内蒙古呼和浩特010031;

内蒙古医科大学;

内蒙古呼和浩特010000;

内蒙古科技大学包头医学院;

内蒙古包头014000;

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正文语种 chi
中图分类病原真菌（霉菌）与放线菌;
关键词
白鲜碱; 须癣毛癣菌; 高通量测序技术; 作用机制;

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