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普氏蹄蝠胃肠道菌群的多样性

         

摘要

[目的]研究普氏蹄蝠(Hipposideros pratti)胃肠道菌群多样性及致病菌的种类.[方法]采用MiSeq高通量测序技术,通过对16S rRNA基因V1-V2区基因进行测序,研究普氏蹄蝠胃肠道细菌的群落组成.应用MG-RAST V3.3.6分析和统计样品序列和操作分类单元(OTU)数目,分析胃肠道菌群物种丰度,并进行聚类分析.[结果]从普氏蹄蝠胃和肠道中分别获得144 998条和275 274条原始序列以及48 332条和91 758条有效序列,分属于894个和756个操作分类单元.胃中菌群丰度指数Chao指数(1 490)和ACE指数(2 221)分别低于肠道菌群的Chao指数(2 051)和ACE指数(3 556);Shannon多样性指数(2.405)低于肠道(2.407);Simpson多样性指数(0.168)高于肠道(0.151).系统进化分析表明胃肠中的细菌主要分布在6个门,均以变形菌门(Proteobacteria)(胃中占56.4%,肠中占46.0%)和厚壁菌门(Firmicutes)(胃中占40.7%,肠中占49.2%)为优势菌门.胃肠道中丰度在0.1%以上的属有24个,胃中优势类群为乳球菌属(Lactococcus)和哈夫尼菌属(Hafnia),分别占整个菌群的26.1%和21.0%;肠道中优势类群为肠球菌属(Enterococcus)和沙门氏菌属(Salmonella),分别占整个菌群的15.2%和12.7%.普氏蹄蝠胃肠道中的优势菌群均为人类的致病菌或者条件致病菌.[结论]普氏蹄蝠携带有大量人类致病菌.因此,应注意防止向人类传播.

著录项

  • 来源
    《微生物学通报》 |2016年第8期|1739-1745|共7页
  • 作者单位

    河南师范大学生命科学学院 河南新乡 453007;

    河南师范大学生命科学学院 河南新乡 453007;

    河南师范大学生命科学学院 河南新乡 453007;

    河南师范大学生命科学学院 河南新乡 453007;

    河南师范大学生命科学学院 河南新乡 453007;

    河南师范大学生命科学学院 河南新乡 453007;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    普氏蹄蝠; 胃肠道; 菌群; 多样性;

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