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不同生长性能苏姜猪保育猪肠道菌群差异分析

         
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摘要

[背景]苏姜猪是优质瘦肉型新品种猪,断奶仔猪受到多方面应激影响会出现生长性能差异.[目的]研究不同生长性能的苏姜猪保育猪肠道菌群结构的异同.[方法]试验选取了同日龄、体重相近、健康情况良好的的保育仔猪100头,在相同的饲养条件下饲养42 d,试验结束选取体重较轻的为弱仔猪,3头弱仔猪体重为18.43±2.37 kg;体重较大的为健康仔猪,3头健康仔猪体重为27.37±1.36kg.屠宰后,采集其空肠和盲肠内容物,提取微生物基因组DNA进行高通量测序分析其菌群结构.[结果]苏姜猪仔猪空肠和盲肠在菌群丰度、多样性上有极显著的差异(P＜0.01).苏姜猪仔猪空肠菌群优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)假单胞菌属(Pseudomonas)的非致病性菌株,占比超过90％.苏姜猪仔猪盲肠优势菌门依次为拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria).门水平组成结构存在差异,弱仔猪厚壁菌门丰度低于健康仔猪、变形菌门丰度高于健康仔猪.苏姜猪盲肠中普雷沃氏菌属(Prevotella)、疣微菌科UCG-005(Ruminococcaceae_UCG-005)、拟普雷沃菌属(Alloprevotella)等与纤维消化有关的菌属丰度较高.弱仔猪与健康仔猪盲肠菌群在属水平结构存在显著差异(P＜0.05),弱仔猪盲肠中普雷沃氏菌-9(Prevotella_9)、埃希菌-志贺菌属(Escherichia-shigella)、疣微菌科UCG-005(Ruminococcaceae_UCG-005)、Norank_f_普雷沃氏菌(norank_f_Prevotellaceae)高于健康仔猪,健康仔猪盲肠中乳酸杆菌属(Lactobacillus)、普雷沃氏菌-2(Prevotella_2)、土孢杆菌属(Terrisporobacter)、狭义梭菌属1(Clostridium_sensu_stricto_l)高于弱仔猪.其中乳酸杆菌属和土孢杆菌属与仔猪健康相关,埃希菌-志贺菌属与疾病相关.[结论]不同生长性能仔猪肠道菌群构成存在显著差异,研究结果为进一步研究苏姜猪肠道菌群的功能提供依据.

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