公共核酸数据库乙肝病毒全基因组序列概况和中国HBV参照序列的建立

吴光华; 丁惠国; 曾长青

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公共核酸数据库乙肝病毒全基因组序列概况和中国HBV参照序列的建立

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截至2007年1月,世界三大核酸数据库(GenBank,EMBL,DDBJ)库中已经登录来自46个国家和地区的HBV全基因组的8种基因型近900条序列.文中对公共核酸数据库中现有的HBV全部基因组序列进行了统计分析并从基因型的地理分布及其临床特征等方面进行了评述,为进一步研究病毒与宿主的关系,以及HBV的人群分布和进化历史提供帮助.同时,通过系统进化分析对所有登录的229条中国地区HBV全基因组序列及其课题组新近完成的59条全基因组序列进行了基因分型,并根据这些序列建立了中国地区B基因型和C基因型的参照序列,为中国地区HBV的突变研究提供了DNA序列参照体系.此外,对于目前不同数据库信息内容和登录情况进行了分析,提出全面结合宿主临床信息和HBV基因组信息研究的建议.

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来源
《自然科学进展》 |2008年第2期|121-129|共9页
作者
吴光华; 丁惠国; 曾长青;
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作者单位

中国科学院研究生院;

北京;

100049;

中国科学院北京基因组研究所;

北京;

101300;

首都医科大学附属北京佑安医院;

北京;

100069;

中国科学院北京基因组研究所;

北京;

101300;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类基础医学;
关键词
公共核酸数据库; HBV全基因组序列; 基因型; 中国地区; 参照序列;

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