目的探究初发类风湿关节炎(RA)患者肠道微生物群落的基因组学(Genomics)特征。方法收集住院的30例初发类风湿关节炎患者(RA组)和30例健康人(对照组)的晨起粪便,收集每份粪便样品的细菌总DNA,PCR扩增,应用ION TORRENT高通量测序平台对16S rDNA基因的V2、V3、V4、V6、V7、V8、V9可变区开展测序,得出2组试验对象的菌群生物信息数据,再基于文献智库信息,对数据进行组间OTU分析、Alpha菌群多样性分析以及LEfSe差异分析。结果相较于健康对照组,在OTU菌群丰度上,初发RA组呈显著降低。借助Shannon指数等完成稀释曲线,同时分析数据复杂度,结果表明,所测的数据量完整,能够反映样本中各微生物的多样性信息。菌群多样性比较得出:2组多样性指数分析中Chao1指数、Simpson指数、Goods_coverage指数、Observe_species指数比较,差异无统计学意义(P>0.05)。与对照组相比,Shannon指数较初发RA组偏小。菌群结构和菌群差异分析得出:2组在门水平和科水平及属水平上,差异具有统计学意义(P<0.05),初发RA患者组放线菌门(Actinobacteria)、双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)、厚壁菌科(Clostridiales Family XIII Incertae Sedis)丰度较健康对照组增加(P<0.05);初发RA患者组木假单胞菌属(Paraprevotella)、Tyzzerella属、类杆菌属(Coprobacter)相对丰度与健康对照组相比明显减少(P<0.05)。结论初发RA患者肠道菌群丰富度、多样性明显低于健康人,部分菌群存在明显差异,今后调节肠道正常菌群将为类风湿关节炎的治疗开辟新路径。
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