中国沿海长蛸(Octopus variabilis)自然群体线粒体COI基因遗传多样性研究

孙宝超; 杨建敏; 孙国华; 刘相全; 刘丽娟; 王卫军; 郑小东

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对我国沿海5个自然群体长蛸的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COI)部分序列进行了测定和分析,经比对获得658bp核苷酸片段,其中碱基T、C、A和G的平均含量分别为37.02%、18.46%、30.15%和14.35%,AT的含量明显高于GC的含量.5个自然群体的长蛸中共发现18个变异位点,得到15个单倍型,包括4个共享单倍型,其中青岛群体的核苷酸差异数K以及平均核苷酸多样性指数Pi最高,烟台群体最低;群体间,青岛群体在群体间核苷酸差异数K、群体间平均每位点核苷酸替代数Dxy和群体间每位点净核苷酸替代数Da三个指标上都表现出比其它群体之间较高的水平,说明青岛群体具有最为丰富的遗传多样性.MEGA 3.1软件计算5个群体间的Kimura 2-paramter遗传距离,大连群体和青岛群体之间的遗传距离最远为0.0077,而大连群体与烟台群体之间的遗传距离最低,为0.0029.AMOVA分析表明,五群体间总遗传分化系数Fst=0.17410(P<0.05),群体间遗传分化远小于群体内.NJ法和UPGMA法构建的分子进化树,5个地理群体的长蛸聚为两个族群,大连、烟台群体聚为一族群,青岛、连云港和舟山群体聚为另一族群.

著录项

来源
《海洋与湖沼》 |2010年第2期|259-265|共7页
作者
孙宝超; 杨建敏; 孙国华; 刘相全; 刘丽娟; 王卫军; 郑小东;
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作者单位

山东省海洋水产研究所,烟台,264006;

上海海洋大学,上海,201306;

山东省海洋水产研究所,烟台,264006;

上海海洋大学,上海,201306;

山东省海洋水产研究所,烟台,264006;

山东省海洋水产研究所,烟台,264006;

山东省海洋水产研究所,烟台,264006;

山东省海洋水产研究所,烟台,264006;

中国海洋大学,青岛,266003;

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正文语种 chi
中图分类动物遗传学;
关键词
长蛸; COI基因; PCR; 遗传多样性;

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