盐胁迫下大麻SSR标记的分布特征分析

陶杰; 张江江; 常丽; 张翠萍; 李建军; 张超; 李德芳; 赵立宁

首页> 中文期刊> 《中国麻业科学》 >盐胁迫下大麻SSR标记的分布特征分析

盐胁迫下大麻SSR标记的分布特征分析

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

为探究盐胁迫对大麻遗传育种改良的影响,试验对盐胁迫条件下大麻转录组测序数据进行了SSR位点标记的挖掘,并对大麻转录组数据中SSR位点标记、SSR位点信息和序列分布特征等进行了分析。结果表明:共检测出84 483条Unigene序列,序列总长87.31 Mb。筛选出27 861个SSR位点,SSR标记的检出率为33.10%,即平均3.13 kb就会出现一个SSR位点,其中以单、二和三碱基重复为主,检出率分别为52.73%、23.26%和22.16%;重复基元主要为A/T、AG/CT、AT/AT和AAG/CTT,分别占52.57%、11.32%、10.25%和6.69%。通过Primer 3.0在线软件获得17 894条SSR引物序列,引物中SSR位点重复长度绝大多数集中在10~21 bp,占SSR重复总数的79.72%,其中最长重复长度为226 bp。该研究构建的盐胁迫下大麻SSR位点信息与分布特征分析,可为研究大麻分子标记辅助育种、EST-SSR标记的开发等提供信息资源。

著录项

来源
《中国麻业科学》 |2022年第1期|5-12|共8页
作者
陶杰; 张江江; 常丽; 张翠萍; 李建军; 张超; 李德芳; 赵立宁;
展开▼
作者单位

中国农业科学院麻类研究所/农业农村部麻类生物学与加工重点实验室;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类大麻（白麻、线麻）;
关键词
大麻; 转录组; SSR标记; 分布特征;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于干旱胁迫下杉木转录组序列的EST-SSR分子标记开发 [J] . 吴夏雷 ,董黎 ,孙宇涵 . 东北林业大学学报 . 2018,第002期
2. 苏打盐碱胁迫下粳稻芽期耐盐碱相关性状与SSR标记关联分析 [J] . 李宪伟 ,郑洪亮 ,赵宏伟 . 华北农学报 . 2018,第002期
3. 干旱、高温胁迫下大豆SSR标记与产量性状关联分析 [J] . 柏锡 ,梁爽 ,邢雪莹 . 东北农业大学学报 . 2015,第10期
4. 中棉所35及中棉所12盐胁迫下的丙二醛含量变化及其SSR指纹图谱构建 [J] . 汪保华 ,王亚峰 ,王长彪 . 中国棉花 . 2011,第011期
5. 盐胁迫下盐草和高羊茅营养器官的离子微区分布 [J] . 贾亚雄 ,李向林 ,万里强 . 中国农业科学 . 2009,第005期
6. 氮磷钾肥对盐胁迫下虉草离子吸收与分布的影响 [C] . ZhANG Yong-liang ,张永亮 ,WANG Xue-yuan . 中国草学会2013学术年会 . 2013
7. 盐胁迫下诱抗剂诱导水稻苗期生长特性及SSR标记初步分析 [A] . 张鑫 . 2010

盐胁迫下大麻SSR标记的分布特征分析

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅