水痘-带状疱疹病毒Oka株和84-7株基因特征的分析

邹蔚然; 刘亚宇; 廖海棠; 麻广; 何云松; 刘晔

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目的对水痘-带状疱疹病毒（varicella-zoster virus,VZV）Oka株和84-7株的部分基因特征进行分析,为建立Oka株和84-7株的鉴别方法提供依据。方法利用PCR技术扩增相关基因,并运用生物信息学软件对水痘-带状疱疹病毒OKa株和84-7株的Pst I酶切位点、抗原蛋白基因序列（ORF14,ORF68）、高突变区域（ORF62）及84-7株复制起点进行序列比较和分析。结果 Oka株酶切位点特征为Pst I-Sma I+Bss HII+Nae I+,84-7株的酶切位点特征为Pst I+Sma I-Bss HII-Nae I-;Oka株和84-7株ORF14编码的蛋白质同源性为99.8%,3个碱基的差异导致了3个氨基酸的变化,且这两株病毒株的R2可变区的串联重复单位拷贝数均为7;Oka株和84-7株ORF68编码的蛋白质同源性为100%,且存在2个低复杂性区域（LCR）;ORF62编码区蛋白质的同源性为99.2%,具有14个低复杂性区域;84-7株复制起点区域包含一个13TA+19GA结构。结论 Oka株和84-7株的同源性很高,但在酶切位点方面存在差异,可用于Oka株和84-7株的鉴别,为今后确立水痘-带状疱疹病毒毒株的鉴别方法提供依据。

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来源
《微生物学免疫学进展》 |2017年第1期|27-31|共5页
作者
邹蔚然; 刘亚宇; 廖海棠; 麻广; 何云松; 刘晔;
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作者单位

成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类呼吸道传染性病毒;
关键词
水痘-带状疱疹病毒; Oka株; 84-7株; 酶切位点; 基因特征; 同源性;

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