猪繁殖与呼吸综合征病毒TJxq1701株全基因组序列分析

杨婧; 王欢欢; 刘野; 李文忠; 石青青; 付旭彬; 李留安; 孙英峰

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为了解天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,2017年从天津某发病猪场采集的疑似PRRSV感染病料,接种Marc-145细胞分离到1株PRRSV毒株,将其命名为TJxq1701株;应用RT-PCR分段扩增出各基因片段,分别克隆到pMD-18T载体鉴定后测序。序列分析结果表明,TJxq1701株基因组全长15321 nt(不包括polyA尾),在分子遗传演化上与HP-PRRSV参考毒株JXA1和JXA1-P80的核酸同源性分别为99.2%和99.7%,与CH-la和VR2332的同源性为95.1%和89.5%,与NADC30同源性为84.4%,而与欧洲型Lelystad virus(LV)株的同源性仅为61.0%。Nsp2基因存在与HP-PRRSV参考毒株位置相同的90个碱基缺失;氨基酸位点分析表明在Nsp1-3、Nsp9-11、Gp2-Gp5存在至少10处以上与JXA1-P80相同的特征性位点突变,推测该分离毒株为JXA1-P80遗传演化毒株(类JXA1-P80毒株)。

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来源
《动物医学进展》 |2022年第6期|1-6|共6页
作者
杨婧; 王欢欢; 刘野; 李文忠; 石青青; 付旭彬; 李留安; 孙英峰;
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作者单位

天津农学院动物科学与动物医学学院;

天津农垦康嘉生态养殖有限公司;

天津瑞普生物技术股份有限公司;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类猪;
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒; 遗传演化; 类疫苗毒株;

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