梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统的鉴别及Erwinia spp. HrpA的分析

朱勃; 金谷雷; 怀雁; 谢关林

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[目的]明确梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统(type Ⅲ secretion system,TTSS)的所在区域、相关基因及Erwiaia spp.的HrpA(hypersensitive response and pathogenicity gene A)选择压水平.[方法]利用生物信息学方法,通过BLAST程序对梨火疫病菌基因组的核苷酸数据库进行同源比对,同时对Erwiaia spp.与宿主互作的表面蛋白HrpA进行选择压分析.[结果] TTSS分析结果显示在40 kb大小的毒力岛上有27个TTSS相关基因.通过与看家基因及毒力岛上的致病性相关的重要基因HrpN的比较、选择压分析、多序列比较,发现HrpA基因处于较强的选择压作用下,且HrpA蛋白N端主要受正向选择,C端主要受净化选择.NJ法构建的HrpA系统发育树显示Erwinia spp.形成两个明显的分支,表明HrpA基因可能在种间分化后产生了不同的选择压变化.[结论]梨火疫病病原菌基因组3.14-3.18 Mb为其TTSS分布区域.该病原菌通过TTSS侵染寄主植物,在其病原菌表面有一种类鞭毛结构的TTSS蛋白HrpA,HrpA作为传输者起着将效应分子输送到宿主内部的功能,在进化上受到了较强的选择压影响.

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来源
《中国农业科学》 |2009年第2期|505-510|共6页
作者
朱勃; 金谷雷; 怀雁; 谢关林;
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作者单位

浙江大学生物技术研究所;

杭州;

310029;

浙江大学生物信息学研究所;

杭州;

310029;

浙江大学生物技术研究所;

杭州;

310029;

浙江大学生物技术研究所;

杭州;

310029;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类植物保护;
关键词
梨火疫病; 三型分泌系统; HrpA; 正向选择; 净化选择;

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