辣椒全基因组TCP转录因子家族生物信息学分析

冯羽娥

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利用生物信息学方法对辣椒TCP转录因子家族成员、基因分类、基因结构、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测和分析.结果表明,辣椒TCP基因家族包含30个成员,CaTCP蛋白含有95～550个氨基酸,等电点为6.30～10.91.进化树分析将其分为11个不同的亚族.辣椒TCP家族进化树以及基因结构的进一步分析,显示辣椒TCP家族可分为两大类,即Class Ⅰ类和Class Ⅱ类,而Class Ⅱ类可分为两个不同的亚类,即CIN和CYC/TB1亚类.位于同一亚家族的大多数TCP基因具有相似的内含子和外显子结构.此外,染色体定位分析表明,辣椒TCP基因不均衡的分布于辣椒的10条染色体上,其中3号染色体上最多,有7个.

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来源
《种子科技》 |2017年第8期|152-154|共3页
作者
冯羽娥;
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作者单位

西北农林科技大学园艺学院,陕西咸阳712100;

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正文语种 chi
中图分类辣椒;
关键词
辣椒; TCP; 转录因子; 全基因组分析;

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