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前列腺癌基因外显子区突变位点筛查及与前列腺癌易感性的关系

         
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目的 筛查前列腺癌(PCA)基因外显子区的突变位点,并分析其与PCA易感性的关系.方法 6例PCA患者,留取PCA组织和癌旁正常组织标本.采用液相杂交捕获技术分析PCA、癌旁正常组织全基因外显子区的单核苷酸多态性(SNPs),采用Illumina HiSeq 2000平台高通量测序将捕获富集并验证的PCA、癌旁正常组织基因外显子区SNPs的DNA文库进行突变位点比对,筛选PCA基因外显子区突变位点.采用bwa软件与参考基因组hg19作比对,分析PCA外显子区功能性突变位点的生物信息学信息,分析功能性突变位点与PCA易感性的关系.结果 共发现4个未报道的功能性SNPs突变位点,分别为BRCA1 rs16941、MET rs45483396、P53 rs121912655、COPB2 rs7374710.进一步通过临床样本检测结果显示,BRCA1 rs16941与COPB2 rs7374710两个SNP不仅均与PCA易感性相关(OR 分别为 1.47,1.27;95% CI 分别为 1.14~1.72;1.20~1.41),而且与PCA患者PSA值 及Gleason评分均呈正相关(OR 分别为1.25,1.37;95% CI =1.10~1.84,1.20~2.34;P均<0.01).结论 PCA外显子区存在BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710功能性突变位点,携带有BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710突变位点的个体罹患PCA的可能性较高.

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