人ligatin样基因HCA56的克隆及其生物信息学分析

曲迅; 杨美香; 孙宝柱; 闫实; 冯进波

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人ligatin样基因HCA56的克隆及其生物信息学分析

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目的利用SEREX方法筛选人肝细胞癌(HCC)cDNA表达文库,克隆能引起机体体液免疫应答的抗原编码基因,并对其进行生物信息学分析,以指导对新克隆基因功能的研究.方法采用ZAP-cDNA Gigapack Ⅲ Gold Cloning试剂盒构建人HCC cDNA表达文库,用患者自体血清进行筛选,对筛选得到的阳性克隆进行序列测定.通过生物信息学对筛选得到的阳性克隆HCA56进行染色体定位、基因结构分析、蛋白序列预测以及相似性搜索和功能分析.逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)检测HCA56的组织表达谱.结果通过对一个cDNA表达文库的筛选,获得了一个血清反应阳性克隆HCA56,全长2021bp,编码584个氨基酸,定位于染色体1q31～q32.数据库搜寻表明它与人ligatin编码基因片段有95%的相似性.RT-PCR显示HCA56广泛分布于各种正常组织.结论 HCA56很可能是ligatin的全长编码基因,生物信息学与分子生物学相互结合是进行新基因研究的有效方法.

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来源
《山东医药》 |2004年第1期|14-16|共3页
作者
曲迅; 杨美香; 孙宝柱; 闫实; 冯进波;
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作者单位

山东大学齐鲁医院,山东济南250012;

山东大学齐鲁医院,山东济南250012;

山东大学齐鲁医院,山东济南250012;

山东大学齐鲁医院,山东济南250012;

山东大学齐鲁医院,山东济南250012;

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正文语种 chi
中图分类分子生物学;
关键词
SEREX HCA56 Ligatin 生物信息学;

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