燕麦SCoT分子标记体系的优化及引物筛选

李进; 陈仕勇

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燕麦SCoT分子标记体系的优化及引物筛选

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摘要

[目的]本研究对影响燕麦目标起始密码子多态性聚合酶链式反应(SCoT-PCR)的4个因素(模板DNA、引物、Mix混合液用量及退火温度)进行了优化,并通过最优体系进行了多态性引物的筛选.[方法]以4份燕麦品种DNA为模板,采用L9 (33)正交试验确定模板DNA、引物、Mix混合液用量的最优反应体系,在48～ 54°C温度范围设置8个梯度进行退火温度筛选,并通过最优体系对80条引物进行了多态性筛选和验证.[结果]优化后的反应体系总体积为20μl,包含2 μl模板DNA(10 ng·μl-1)、2μl引物(10 μmol· L-1)、9μl Mix和7μl ddH2O.筛选出了扩增效果和多态性较好的36条引物及各自的最佳退火温度.[结论]成功优化建立燕麦SCoT-PCR扩增体系,该体系的建立将为燕麦品种遗传多样性分析、品种指纹图谱构建以及分子标记辅助育种等提供重要的参考依据.

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来源
《西南农业学报》 |2021年第5期|940-944|共5页
作者
李进; 陈仕勇;
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作者单位

西南民族大学青藏高原研究院四川成都610041;

四川省抗逆牧草种质创新及生态修复工程实验室四川成都610041;

西南民族大学畜牧兽医学院四川成都610041;

四川省抗逆牧草种质创新及生态修复工程实验室四川成都610041;

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正文语种 chi
中图分类燕麦;
关键词
燕麦; SCoT; 体系优化; 引物筛选;

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