烟草不育系与保持系线粒体DNA的重测序研究

昌洪涛; 朱列书; 彭妙; 李安; 鲁柯佚

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烟草不育系与保持系线粒体DNA的重测序研究

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基于重测序技术,对两对不育系和对应的保持系材料的线粒体DNA进行重测序,统计并分析了不育系与保持系线粒体DNA编码区序列的突变位点,探讨了这些突变位点与烟草胞质不育的关系.对重测序结果比对分析可知:不育系和保持系在orf106b上具有一致的1个InDel位点,在orf138a、orf121b、orf129b和orf110b上具有一致的SNP位点,这些突变位点没有造成不育系与保持系编码区序列的差异,推测这些突变位点可能与CMS无关;不育系MSK326和MSK394在orf112a和orf103c上有相同的InDel位点;MSK326和MSK394在65个基因片段或开放阅读框上有一致SNP位点,且这些突变没有出现在保持系线粒体编码区.这些基因片段或开放阅读框上的InDel和SNP突变都导致了基因或开放阅读框编码序列的改变,并且造成了氨基酸的突变,推测可能与烟草CMS密切的相关.其中atp1、atp4、atp6、coxl、cox3、atp9、orf25、nad6、nad7、orf108、orf239、orf129、sdh4等基因或开放阅读框上的突变位点与报道研究一致,均被报道与烟草CMS存在密切的联系.本研究所挖掘的这些大量基因片段上的InDel和SNP位点,不仅有助于烟草CMS机理的进一步研究,也为烟草不育系育种研究提供有力的遗传工具.

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来源
《天津农业科学》 |2016年第6期|1-8|共8页
作者
昌洪涛; 朱列书; 彭妙; 李安; 鲁柯佚;
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作者单位

湖南农业大学农学院;

湖南长沙410128;

湖南农业大学农学院;

湖南长沙410128;

湖南农业大学生物科学技术学院;

湖南长沙410128;

湖南农业大学生物科学技术学院;

湖南长沙410128;

湖南农业大学农学院;

湖南长沙410128;

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正文语种 chi
中图分类烟草（菸草）;
关键词
烟草; 线粒体DNA; 重测序;

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